Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOGA3Q5TF21 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms