Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC27.55■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC27.55■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC27.55■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FRMPD1Q5SYB0 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms