Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PCID2Q5JVF3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCID2Q5JVF3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms