Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms