Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALFQ53S48 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALFQ53S48 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALFQ53S48 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALFQ53S48 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALFQ53S48 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALFQ53S48 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALFQ53S48 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALFQ53S48 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALFQ53S48 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALFQ53S48 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALFQ53S48 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALFQ53S48 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALFQ53S48 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALFQ53S48 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALFQ53S48 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALFQ53S48 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALFQ53S48 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALFQ53S48 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALFQ53S48 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALFQ53S48 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALFQ53S48 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALFQ53S48 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALFQ53S48 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALFQ53S48 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALFQ53S48 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALFQ53S48 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALFQ53S48 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALFQ53S48 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms