Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms