Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KNOP1Q1ED39 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KNOP1Q1ED39 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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