Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALX1Q15699 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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