Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC23BQ15437 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms