Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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