Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NCAPHQ15003 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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