Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
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RFTN1Q14699 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RFTN1Q14699 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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