Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMC1AQ14683 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
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