Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IHHQ14623 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
IHHQ14623 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IHHQ14623 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IHHQ14623 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IHHQ14623 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IHHQ14623 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IHHQ14623 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
IHHQ14623 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IHHQ14623 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IHHQ14623 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IHHQ14623 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IHHQ14623 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IHHQ14623 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IHHQ14623 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IHHQ14623 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IHHQ14623 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IHHQ14623 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IHHQ14623 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
IHHQ14623 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IHHQ14623 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IHHQ14623 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IHHQ14623 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IHHQ14623 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
IHHQ14623 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
IHHQ14623 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IHHQ14623 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IHHQ14623 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
IHHQ14623 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IHHQ14623 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IHHQ14623 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IHHQ14623 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IHHQ14623 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IHHQ14623 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IHHQ14623 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IHHQ14623 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IHHQ14623 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IHHQ14623 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IHHQ14623 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IHHQ14623 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IHHQ14623 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IHHQ14623 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IHHQ14623 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IHHQ14623 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IHHQ14623 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
IHHQ14623 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IHHQ14623 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IHHQ14623 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
IHHQ14623 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IHHQ14623 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IHHQ14623 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IHHQ14623 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IHHQ14623 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IHHQ14623 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IHHQ14623 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IHHQ14623 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IHHQ14623 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IHHQ14623 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IHHQ14623 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IHHQ14623 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IHHQ14623 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IHHQ14623 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IHHQ14623 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IHHQ14623 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IHHQ14623 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IHHQ14623 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IHHQ14623 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IHHQ14623 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IHHQ14623 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IHHQ14623 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
IHHQ14623 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IHHQ14623 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IHHQ14623 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IHHQ14623 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IHHQ14623 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IHHQ14623 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IHHQ14623 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
IHHQ14623 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IHHQ14623 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IHHQ14623 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IHHQ14623 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IHHQ14623 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IHHQ14623 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IHHQ14623 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IHHQ14623 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IHHQ14623 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
IHHQ14623 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
IHHQ14623 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IHHQ14623 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IHHQ14623 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IHHQ14623 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
IHHQ14623 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IHHQ14623 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IHHQ14623 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IHHQ14623 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IHHQ14623 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IHHQ14623 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IHHQ14623 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IHHQ14623 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
IHHQ14623 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms