Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
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