Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
FAM53BQ14153 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM53BQ14153 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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