Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NEUROD1Q13562 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
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