Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC31.32■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC31.32■■■□□ 2.61
PRDM2Q13029 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
PRDM2Q13029 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms