Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXI1Q12951 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms