Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHD3Q12873 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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