Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TWF1Q12792 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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