Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms