Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP4Q09028 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms