Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCK1Q08629 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms