Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms