Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms