Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
CYP4A11Q02928 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.3 ms