Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms