Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A2Q01362 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms