Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BEX3Q00994 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BEX3Q00994 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BEX3Q00994 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BEX3Q00994 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BEX3Q00994 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BEX3Q00994 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BEX3Q00994 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BEX3Q00994 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BEX3Q00994 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BEX3Q00994 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BEX3Q00994 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BEX3Q00994 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BEX3Q00994 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BEX3Q00994 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BEX3Q00994 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BEX3Q00994 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BEX3Q00994 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BEX3Q00994 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BEX3Q00994 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BEX3Q00994 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BEX3Q00994 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BEX3Q00994 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BEX3Q00994 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BEX3Q00994 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BEX3Q00994 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BEX3Q00994 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BEX3Q00994 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BEX3Q00994 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BEX3Q00994 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BEX3Q00994 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BEX3Q00994 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BEX3Q00994 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BEX3Q00994 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BEX3Q00994 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BEX3Q00994 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BEX3Q00994 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BEX3Q00994 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BEX3Q00994 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BEX3Q00994 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BEX3Q00994 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BEX3Q00994 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BEX3Q00994 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BEX3Q00994 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms