Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1BQ00975 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms