Protein–RNA interactions for Protein: Q00796

SORD, Sorbitol dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORDQ00796 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SORDQ00796 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SORDQ00796 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SORDQ00796 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SORDQ00796 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SORDQ00796 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SORDQ00796 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SORDQ00796 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SORDQ00796 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SORDQ00796 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SORDQ00796 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SORDQ00796 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SORDQ00796 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SORDQ00796 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SORDQ00796 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SORDQ00796 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SORDQ00796 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SORDQ00796 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SORDQ00796 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SORDQ00796 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SORDQ00796 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SORDQ00796 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SORDQ00796 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SORDQ00796 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SORDQ00796 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SORDQ00796 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SORDQ00796 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SORDQ00796 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SORDQ00796 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SORDQ00796 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SORDQ00796 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SORDQ00796 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SORDQ00796 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SORDQ00796 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SORDQ00796 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SORDQ00796 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SORDQ00796 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SORDQ00796 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SORDQ00796 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SORDQ00796 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SORDQ00796 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SORDQ00796 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SORDQ00796 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SORDQ00796 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SORDQ00796 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SORDQ00796 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SORDQ00796 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SORDQ00796 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SORDQ00796 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SORDQ00796 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SORDQ00796 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SORDQ00796 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SORDQ00796 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SORDQ00796 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SORDQ00796 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SORDQ00796 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SORDQ00796 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SORDQ00796 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SORDQ00796 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SORDQ00796 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SORDQ00796 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SORDQ00796 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SORDQ00796 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SORDQ00796 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SORDQ00796 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SORDQ00796 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SORDQ00796 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SORDQ00796 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SORDQ00796 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SORDQ00796 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SORDQ00796 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SORDQ00796 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SORDQ00796 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SORDQ00796 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SORDQ00796 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SORDQ00796 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SORDQ00796 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SORDQ00796 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SORDQ00796 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SORDQ00796 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SORDQ00796 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SORDQ00796 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SORDQ00796 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SORDQ00796 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SORDQ00796 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SORDQ00796 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SORDQ00796 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SORDQ00796 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SORDQ00796 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SORDQ00796 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SORDQ00796 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SORDQ00796 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SORDQ00796 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SORDQ00796 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SORDQ00796 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SORDQ00796 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SORDQ00796 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SORDQ00796 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SORDQ00796 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SORDQ00796 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms