Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR2FP61218 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2FP61218 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms