Protein–RNA interactions for Protein: P59665

DEFA1, Neutrophil defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA1P59665 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA1P59665 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms