Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA4P52798 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms