Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2A2P52657 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms