Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPC3P51654 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPC3P51654 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPC3P51654 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPC3P51654 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPC3P51654 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPC3P51654 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPC3P51654 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPC3P51654 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPC3P51654 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPC3P51654 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GPC3P51654 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPC3P51654 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPC3P51654 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GPC3P51654 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPC3P51654 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPC3P51654 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPC3P51654 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPC3P51654 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPC3P51654 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPC3P51654 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPC3P51654 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPC3P51654 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPC3P51654 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPC3P51654 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPC3P51654 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPC3P51654 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPC3P51654 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPC3P51654 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPC3P51654 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPC3P51654 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GPC3P51654 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPC3P51654 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPC3P51654 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPC3P51654 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPC3P51654 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPC3P51654 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPC3P51654 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPC3P51654 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPC3P51654 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPC3P51654 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GPC3P51654 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPC3P51654 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPC3P51654 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GPC3P51654 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPC3P51654 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPC3P51654 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPC3P51654 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPC3P51654 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPC3P51654 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPC3P51654 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPC3P51654 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPC3P51654 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPC3P51654 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPC3P51654 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPC3P51654 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPC3P51654 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPC3P51654 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPC3P51654 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPC3P51654 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPC3P51654 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPC3P51654 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPC3P51654 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPC3P51654 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPC3P51654 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPC3P51654 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPC3P51654 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPC3P51654 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPC3P51654 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPC3P51654 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPC3P51654 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPC3P51654 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GPC3P51654 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GPC3P51654 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPC3P51654 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GPC3P51654 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPC3P51654 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPC3P51654 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GPC3P51654 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPC3P51654 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPC3P51654 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPC3P51654 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPC3P51654 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPC3P51654 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPC3P51654 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPC3P51654 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPC3P51654 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPC3P51654 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPC3P51654 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPC3P51654 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPC3P51654 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GPC3P51654 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GPC3P51654 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPC3P51654 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPC3P51654 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPC3P51654 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPC3P51654 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GPC3P51654 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPC3P51654 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPC3P51654 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms