Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
SMARCA4P51532 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
SMARCA4P51532 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
SMARCA4P51532 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SMARCA4P51532 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SMARCA4P51532 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SMARCA4P51532 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SMARCA4P51532 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SMARCA4P51532 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
SMARCA4P51532 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
SMARCA4P51532 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
SMARCA4P51532 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SMARCA4P51532 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SMARCA4P51532 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SMARCA4P51532 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SMARCA4P51532 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SMARCA4P51532 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SMARCA4P51532 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SMARCA4P51532 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SMARCA4P51532 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SMARCA4P51532 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SMARCA4P51532 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SMARCA4P51532 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SMARCA4P51532 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SMARCA4P51532 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
SMARCA4P51532 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SMARCA4P51532 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SMARCA4P51532 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
SMARCA4P51532 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SMARCA4P51532 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SMARCA4P51532 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SMARCA4P51532 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SMARCA4P51532 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SMARCA4P51532 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SMARCA4P51532 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SMARCA4P51532 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SMARCA4P51532 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SMARCA4P51532 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SMARCA4P51532 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SMARCA4P51532 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SMARCA4P51532 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SMARCA4P51532 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SMARCA4P51532 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SMARCA4P51532 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SMARCA4P51532 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SMARCA4P51532 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SMARCA4P51532 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SMARCA4P51532 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SMARCA4P51532 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms