Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NUP153P49790 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NUP153P49790 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NUP153P49790 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NUP153P49790 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NUP153P49790 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NUP153P49790 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NUP153P49790 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NUP153P49790 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NUP153P49790 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NUP153P49790 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NUP153P49790 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NUP153P49790 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NUP153P49790 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NUP153P49790 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NUP153P49790 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NUP153P49790 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NUP153P49790 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NUP153P49790 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NUP153P49790 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUP153P49790 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUP153P49790 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUP153P49790 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUP153P49790 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUP153P49790 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NUP153P49790 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUP153P49790 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUP153P49790 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUP153P49790 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUP153P49790 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUP153P49790 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUP153P49790 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NUP153P49790 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUP153P49790 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUP153P49790 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NUP153P49790 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUP153P49790 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUP153P49790 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUP153P49790 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUP153P49790 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP153P49790 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP153P49790 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP153P49790 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP153P49790 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP153P49790 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP153P49790 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP153P49790 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP153P49790 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP153P49790 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP153P49790 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP153P49790 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP153P49790 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP153P49790 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP153P49790 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP153P49790 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP153P49790 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP153P49790 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP153P49790 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP153P49790 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP153P49790 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP153P49790 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP153P49790 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP153P49790 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP153P49790 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP153P49790 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP153P49790 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP153P49790 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP153P49790 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP153P49790 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP153P49790 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP153P49790 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP153P49790 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP153P49790 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP153P49790 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP153P49790 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP153P49790 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP153P49790 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP153P49790 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP153P49790 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP153P49790 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP153P49790 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP153P49790 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP153P49790 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP153P49790 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP153P49790 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP153P49790 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP153P49790 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP153P49790 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP153P49790 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP153P49790 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP153P49790 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP153P49790 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP153P49790 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP153P49790 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP153P49790 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP153P49790 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP153P49790 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP153P49790 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP153P49790 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP153P49790 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms