Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSEN1P49768 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms