Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXA1P49639 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms