Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTPAP49638 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTPAP49638 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTPAP49638 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTPAP49638 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTPAP49638 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTPAP49638 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTPAP49638 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTPAP49638 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTPAP49638 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTPAP49638 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTPAP49638 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTPAP49638 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTPAP49638 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTPAP49638 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTPAP49638 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTPAP49638 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTPAP49638 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTPAP49638 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTPAP49638 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTPAP49638 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TTPAP49638 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTPAP49638 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTPAP49638 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTPAP49638 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TTPAP49638 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTPAP49638 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTPAP49638 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTPAP49638 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTPAP49638 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTPAP49638 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTPAP49638 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTPAP49638 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTPAP49638 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTPAP49638 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTPAP49638 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTPAP49638 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TTPAP49638 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TTPAP49638 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TTPAP49638 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TTPAP49638 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTPAP49638 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTPAP49638 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTPAP49638 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TTPAP49638 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTPAP49638 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTPAP49638 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTPAP49638 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTPAP49638 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTPAP49638 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTPAP49638 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTPAP49638 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTPAP49638 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTPAP49638 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TTPAP49638 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTPAP49638 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TTPAP49638 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTPAP49638 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTPAP49638 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTPAP49638 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTPAP49638 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTPAP49638 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTPAP49638 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTPAP49638 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTPAP49638 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTPAP49638 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTPAP49638 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTPAP49638 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TTPAP49638 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTPAP49638 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTPAP49638 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTPAP49638 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTPAP49638 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTPAP49638 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTPAP49638 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTPAP49638 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTPAP49638 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTPAP49638 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTPAP49638 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTPAP49638 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTPAP49638 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTPAP49638 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTPAP49638 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TTPAP49638 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTPAP49638 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTPAP49638 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TTPAP49638 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTPAP49638 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTPAP49638 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTPAP49638 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTPAP49638 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTPAP49638 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TTPAP49638 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTPAP49638 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTPAP49638 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTPAP49638 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTPAP49638 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTPAP49638 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTPAP49638 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTPAP49638 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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