Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK8P49336 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK8P49336 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK8P49336 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK8P49336 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK8P49336 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK8P49336 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK8P49336 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK8P49336 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK8P49336 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK8P49336 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK8P49336 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK8P49336 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK8P49336 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK8P49336 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK8P49336 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK8P49336 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK8P49336 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK8P49336 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK8P49336 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK8P49336 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK8P49336 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK8P49336 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK8P49336 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK8P49336 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK8P49336 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK8P49336 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK8P49336 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK8P49336 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK8P49336 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK8P49336 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK8P49336 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK8P49336 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK8P49336 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK8P49336 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK8P49336 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK8P49336 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK8P49336 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK8P49336 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK8P49336 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK8P49336 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK8P49336 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK8P49336 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK8P49336 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK8P49336 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK8P49336 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK8P49336 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK8P49336 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK8P49336 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK8P49336 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK8P49336 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK8P49336 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK8P49336 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK8P49336 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK8P49336 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK8P49336 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK8P49336 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK8P49336 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK8P49336 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK8P49336 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK8P49336 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK8P49336 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK8P49336 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK8P49336 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK8P49336 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK8P49336 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK8P49336 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK8P49336 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK8P49336 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK8P49336 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK8P49336 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK8P49336 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK8P49336 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK8P49336 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK8P49336 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK8P49336 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK8P49336 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK8P49336 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK8P49336 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK8P49336 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK8P49336 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK8P49336 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK8P49336 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK8P49336 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK8P49336 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK8P49336 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK8P49336 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK8P49336 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK8P49336 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK8P49336 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK8P49336 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK8P49336 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK8P49336 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK8P49336 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK8P49336 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK8P49336 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK8P49336 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK8P49336 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK8P49336 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK8P49336 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms