Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LHX1P48742 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LHX1P48742 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LHX1P48742 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LHX1P48742 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LHX1P48742 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LHX1P48742 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LHX1P48742 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LHX1P48742 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LHX1P48742 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LHX1P48742 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LHX1P48742 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LHX1P48742 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LHX1P48742 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LHX1P48742 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LHX1P48742 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LHX1P48742 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LHX1P48742 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LHX1P48742 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LHX1P48742 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LHX1P48742 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LHX1P48742 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LHX1P48742 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LHX1P48742 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LHX1P48742 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LHX1P48742 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LHX1P48742 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX1P48742 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX1P48742 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX1P48742 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX1P48742 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX1P48742 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX1P48742 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX1P48742 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX1P48742 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX1P48742 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX1P48742 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX1P48742 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX1P48742 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX1P48742 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX1P48742 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX1P48742 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX1P48742 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX1P48742 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX1P48742 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX1P48742 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX1P48742 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX1P48742 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX1P48742 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX1P48742 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX1P48742 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX1P48742 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX1P48742 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX1P48742 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX1P48742 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX1P48742 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX1P48742 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX1P48742 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LHX1P48742 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LHX1P48742 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LHX1P48742 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LHX1P48742 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LHX1P48742 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LHX1P48742 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LHX1P48742 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LHX1P48742 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LHX1P48742 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LHX1P48742 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LHX1P48742 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LHX1P48742 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LHX1P48742 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LHX1P48742 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LHX1P48742 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LHX1P48742 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LHX1P48742 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LHX1P48742 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LHX1P48742 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
LHX1P48742 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LHX1P48742 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LHX1P48742 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LHX1P48742 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LHX1P48742 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
LHX1P48742 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LHX1P48742 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX1P48742 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX1P48742 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX1P48742 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX1P48742 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX1P48742 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX1P48742 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX1P48742 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX1P48742 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX1P48742 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX1P48742 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX1P48742 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX1P48742 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX1P48742 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX1P48742 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX1P48742 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX1P48742 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms