Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PITPNBP48739 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms