Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms