Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM23P36406 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM23P36406 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms