Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA7P31268 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms