Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CMPK1P30085 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms