Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms